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Thread: Las Mitocondrias, el Acido Cítrico y el Cancer...

  1. #31

  2. #32

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    Cómo vamos:

    - Ya casi estoy repuesto de la lesión que sufrí y que me ha tenido la mayor parte del tiempo en la cama durante varias semanas. Estoy dispuesto a cuidar mejor de mi salud, para no volver a pasar por un episodio así, a ser posible, por un largo rato.

    - Ordenando mis apuntes escolares... ya avancé mucho la parte "Higiénica" del asunto. Poner las cosas en el orden correcto, referenciarlas con sitios externos, ir juntando los programas informáticos a usar... aunque todavía queda bastante por hacer en ese aspecto.

    … después de eso, vendrá el auténtico trabajo de investigación documental... y hacer experimentos.

    - Siempre sí decidí montar algo modesto para hacer algunas cosas básicas de biología... e ir a contactar algunas personas del instituto que tengo cerca.

    Por el momento, así vamos.
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  3. #33

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    Le hice ajustes a mi microscopio... unos ajustes hechizos. Sin embargo ahora puedo ver con relativa facilidad núcleos celulares e ingluso ver algunos detalles, cuando las combinación de luz y enfoque es perfecta.... estoy logrando más de 2500 aumentos.

    Me falta cristalería... y mucho del equipo básico...

    Voy poco a poco.
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  4. #34

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    Bueno... había dicho más arriba que un enfoque de inteligencia artificial para crear y procesar los datos de bases de datos biológicas, podia ser una posibilidad... pero jamás me imaginé que ya existieran proyectos tan enormes en ese aspecto.

    https://es.wikipedia.org/wiki/Cyc

    https://en.wikipedia.org/wiki/BioCyc...ase_collection

    https://www.youtube.com/watch?v=AMvuhfOMkJQ



    ¿Y como di con él?

    https://en.m.wikipedia.org/wiki/Biochemical_cascade

    Como se vé, en realidad, en los últmos años ha estallado el número de bases de datos qeu ofrecen información biológica.

    Hay que ponernos al día.

    Seguimos estudiando.
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  5. #35

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    Para nada... pero para nada he terminado de poner en orden mis notas.

    Y todavía falta un periodo largo, en las que voy a actualizarlas.

    Pero tengo paciencia...

    No voy rápido ni lento.
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  6. #36

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    Mis "brillantes nociones" ya tienen bastantes años de haber sido implementadas...

    https://es.wikipedia.org/wiki/Modela...tab%C3%B3licas

    … pues ¡Que bien!.

    Seguiremos estudiando.
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  7. #37

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    De momento estoy haciendo una labor relativamente "aburrida"... sin embargo, lo estoy haciendo para posteriormente, poder encontrar por todo el internet la información que necesito.

    El internet está lleno de información, y solo hay que saber como buscarla, como encontrarla... como manejarla.

    Con poderosos nuevos enfoques que estoy intentando implementar.

    Cuando realmente arranque mi estudio... necesitaré uno o varios discos externos para guardar toda la información. A un solo toque... se me despliegan toneladas de información sobre un concepto.

    --------------------------------------------
    Es motivante detenerse un momento, y ver que puedo encontrar, por ejemplo, buenos videos como estos, sobre el plegamiento de las proteínas con asistencia y control de chaperonas, como la calnexina…

    https://www.youtube.com/watch?v=nEHe3Aie9Ek

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  8. #38

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    Ayer... no pude evitar sentirme un poco triste de ver que algunas ideas que yo consideraba originales y únicas (i.e. aplicación de la IA y la modelación matemática al metabolismo), ya tienen años o hasta lustros de implementación.

    Sin embargo, soy yo el que, por ejemplo estos temas de biología, los abandono durante años y hasta lustros... y el progreso, por supuesto, no se detiene.

    Vivimos en un mundo inestable... mi ánimo, mi salud mental y física... son inestables... y por supuesto, tienen fecha de caducidad, incluso. El ambiente donde me muevo es inestable en sí... y sin embargo, no vivo en un lugar donde tema que en la mañana salga a hacer cosas y me encuentre con una balacera (como algunos foristas de este foro)… pero por supuesto, TAMBIEN este ambiente, y estos tiempos, son inestables... y esto también tiene su inestabilidad... pero sobre todo, fecha de caducidad... como este país.

    Todo en nuestra vida es aleatorio... y los momentos tristes y alegres, también.

    Ya no me siento triste.
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  9. #39

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    Un buen libro, tengo que conseguirlo.

    https://kissly.net/book/A9E5A8214F77...fnom&x=3286934
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  10. #40

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    Pero, de todas maneras, seguiré en esa linea...

    Repasos: Cursos de Prolog y Programación Lógica:

    Curso de Prolog por un Hindú, cuyo inglés no es tan incomprensible... es muy incómodo, que el curso consta de 78 videos, la mayoría muy corto (promedio: 5 min.)

    https://www.youtube.com/watch?v=rSZS...oqplBhJF91Mwkp

    Curso de un Angloparlante, 1 solo video de una hora.

    https://www.youtube.com/watch?v=SykxWpFwMGs

    Curso de 27 videos, de un tipo con cara de Pakistaí, con no tan mal inglés.

    https://www.youtube.com/watch?v=4vv3...OO8ch_Di7T8_9E

    ------------------------

    Nota:

    Una cosa es aprender este lenguaje, y otro es aprender a utilizarlo en forma "util", y por ahí debe haber - aunque no se donde - donde se enseñe eso.

    La filosofía Mecatrónica, ofrece un punto de vista muy, pero muy interesante, de como utilizar la Programación Lógica. Sería cuestión de buscar más.
    (Edición de firma).

  11. #41

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    José Antonio le preguntó al Dr. Halabe Bucay sobre publicaciones serias sobre el ácido cítrico como tratamiento de cáncer... parece que no quedó muy satisfecho con su respuesta.

    Pasando ahora a una sustancia que va en ese sentido, con el mismo mecanismo, pero con efectos potenciados - el dicloracetato - tenemos miles de entradas en la base de datos del NCBI.

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/search/...ichloroacetate

    Ciertamente, he tomado algunos cursos de Biología Molecular, y al leer un artículo científico, entiendo casi todo... pero me doy cuenta que cosas tan básicas como dominar las bases de datos, el software, y todo lo que ofrecen las grandes bases de datos públicas biológicas... ES ALGO QUE NO HE EXPLOTADO.

    También, tengo una tendencia a querer construir mi propio conocimiento desde cero... mis propios métodos desde cero... pero eso, en mi limitado tiempo, no me va a llevar muy lejos.

    Después de terminar el trabajo de repaso de estos cursos,... todavía deberemos hacer un esfuerzo por dominar esa información. Lo cual, tampoco está peleado, con hacerlo a mi manera.

    Original y poderosa.

    ;).
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  12. #42

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    Intento de enciclopedia informatica del "Instituto Quimico Biológico". (España)

    Llegué aquí porque tenían información interesante sobre el cromosoma 6. (https://www.iqb.es/cromosomas/cromosoma06.htm)

    Me parece que es un punto de vista interesante... pero requería una cantidad de trabajo, y no lo avanzaron mucho.

    https://www.iqb.es/mapa.htm

    -------------------------------
    ¿Que veo en Wikipedia?

    Al menos para el Cromosoma 1:

    Para cada entrada de un cromosoma en la Wikipedia en inglés, se tiene el gene o la familia de genes, y se da el locus aproximado. Esto luego puede buscarse en NCBI, donde tienen mapas detallados que pueden aumentarse por órdenes de magnitud… (no se si hasta nucleótidos invidivuales). Aunque también se puede buscar a un gene por su nombre.

    Hasta abajo, se tienen las enfermedades genéticas identificadas con ese cromosoma... aunque aquí no se detallan los loci... pueden quizá cruzarse a mano con la información de arriba.
    (Edición de firma).

  13. #43

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    https://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_1

    Mmmm…. pero según recuerdo, cada entrada de gene en Wikipedia en inglés, tiene el locus exacto... e incluso, desde ahí mismo se dan link para accesar a bases de datos públicas.... que se van llamando una a la otra (e.g. artículos científicos y médicos sobre ese gen)… por lo que se cierra el círculo.
    Last edited by Sirius2b; 14-11-19 at 04:23 PM.
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  14. #44

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    Mmm… en mis viejas notas encontré que los perros tienen un cáncer venéreo transmisible, similar al cáncer facial de los Demonios de Tasmania.

    Ya hablando sobre cosas que realmente funcionan contra el cáncer, y no solo especulaciones, tenemos por ejemplo a la planta anti-cáncer Catharanthus roseus… productoras del alcaloide "Vincristine". Muy utilizado para combatir tumores, no solo de humanos... también en perros y otros mamíferos.

    https://en.wikipedia.org/wiki/Catharanthus_roseus

    El Vincristine, no parece ser muy caro - salvo si uno vive en Venezuela... o en el futuro de algunos años, en México - Debe ser administrado con cuidado, porque una inyección mal colocada, puede ser LETAL.

    Canharanthus pertenece a Eudicots --> Asteridas --> Gentinales…. un orden algo exótico, al menos no se ve en un curso introductorio de botánica.

    Interesante.
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  15. #45

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    Ejemplo de un Visualizador Genómico, este desarrollado por la UCSC (University of California, Santa Cruz). El link de abajo muestra el Cromosoma 1.

    El visualizador puede aumentarse muchos órdenes de magnitud (casi, creo, hasta pares de bases), o como se vé, mostrar todo el cromosoma. Puede darse clic directamente en el ideograma del cromosoma, si uno puede guiarse en lo que busca, por el bandeo.

    Nótese las numerosísimas opciones (docenas) para centrar la búsqueda.

    http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTra...tbU3DZeinaYlPG

    El sitio tiene los genomas de los organismos modelo más comunes (Aradobiopsis taliana, Mus musculus, etc.), y aspira a expanderse.

    Este visualizador, creo que está empotrado en algunas páginas del NCBI.

    Sitio: http://genome.ucsc.edu/index.html
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  16. #46

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    Mi filosofía...

    Un genetista (o un médico, o un biólogo) debe conocer a los cromosomas humanos íntimamente, como sus "amigos"... quizá nunca logre entenderlos por completo... pero si lo suficiente para tratar con ellos, saber cuando están en una situación anormal, y que consecuencias trae eso.

    Algo que vale la pena estudiar... algo fijo, que durará... y si no dura... jo, jo…

    Todavía mejor.
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  17. #47

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    Este tema... ¿Lo estamos viendo en orden o en desorden? Digamos que lo estamos viendo en desorden... pero no es tan grave.

    Siempre y cuando quede claro a que materia y tema pertenece cada cosa que pongamos acá, o implícitamente quede suficientemente claro, creo que no hay problema.

    Creo que ya llegó el momento, de ir poniendo algunos videos interesantes.
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  18. #48

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    Materia: Tec. Biología Molecular.
    Tema: Inmunología (CMH, HLA, Cromosoma 6, Anticuerpos, etc.)

    Nótese que este curso nos hace avanzar mucho en distintos temas que se necesitan ver en Biología Molecular.

    Este curso sí hay que bajarlo.

    Curso completo de la Universidad de Valladolid (España).

    Lista de Reproducción: https://www.youtube.com/watch?v=IdM7...afihsdvEmW2dng

    Video inicial:

    (Edición de firma).

  19. #49

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    Muy buenos videos.... divertidos e ingeniosos...

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  20. #50

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  21. #51

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    Muy buen curso...



    71 videos... pero vale la pena.
    (Edición de firma).

  22. #52

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    (Edición de firma).

  23. #53

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    Materia: Tec Biol Mol
    Tema: Citometría de Flujo.
    (-->Integridad de Membrana + Diferenciación Necrosis / Apoptosis)

    Estoy ordenando mis apuntes de Tec Biol Mol. y por lo tanto, este ciclo estará lleno de videos sobre técnicas de laboratorio.

    Comenzamos con lo más básico: La tinción vital de Yoduro de Propidio.
    (Youtube: popidium iodide flow cytometry)

    Teoría de Citometría de flujo:
    https://www.youtube.com/watch?v=B2zreF2dnWk

    Como funciona la Citometría de flujo:
    https://www.youtube.com/watch?v=WPjSDBtjkGI

    Preparación de la muestra para Citometría de Flujo.
    https://www.youtube.com/watch?v=JuHk08g6NMg
    https://www.youtube.com/watch?v=W1BFeiDwqnk



    Detección de Apoptosis con Yoduro de Propidio + Citometría de Flujo.
    https://www.youtube.com/watch?v=ejxTkLZ_MEA
    https://www.youtube.com/watch?v=7hScnHS9ylU



    -----------------------

    Si tenemos una sustancia como la que discutimos aqui (Acido cítrico, o bien diCloracetato)... tenemos que poder medir sus efectos, de acuerdo a la teoría que propone: que promueve la apoptosis. Por lo tanto, esta es una forma de medirlo, si incubamos células cancerosas con esa sustancia.

    Ya veremos si nos quedamos con algunos o todos estos videos.
    (Edición de firma).

  24. #54

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    Y si no se dispone de un citómetro? Bueno, me supongo que algo se podrá hacer con una cámara de Neubauer.
    (Edición de firma).

  25. #55

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    Materia: Botánica.
    Tema: Eudicots --> Asteridas --> Orden: Gentianales.

    Habíamos dicho, que uno de los fármacos anticancerígenos más poderosos conocidos, era el alcalode "Vincristine", extaido de la planta Cantharantheus roseus, una planta de Madagascar, perteneciente al orden Gentianales.

    https://en.wikipedia.org/wiki/Vincristine
    https://en.wikipedia.org/wiki/Catharanthus_roseus

    El vincristine, estorba la polimerización de la tubuluna, y por lo tanto la formación de un huso mitótico funcional durante la metafase.

    https://www.youtube.com/watch?v=O08Y7PcLg8M


    Los Gentianales son hermanos de Solanales (chiles) y Lamiales (mentas, salvias)... por lo tanto, pertenece a un grupo de plantas que se destacan por sus capacidades químicas y propiedades medicinales.
    (ver diagrama de Asteridas)

    Apocynaceae, donde se encuentra Cantharantus, es uno de las familias más evolucionadas del órden.

    https://en.wikipedia.org/wiki/Apocynaceae

    - Aunque no se menciona tanto, la familia no es pequeña: 5,100 especies.
    - Son plantas más bien del viejo mundo, no tanto de las Americas.
    - Es más abundante en los bosques tropicales de la región Indo-Malaya.
    - Gran parte de esta familia tiende a defenderse mediante su savia, a veces con latex, con contenidos tóxicos. A veces venenos muy poderosos.
    - Esta afinidad por la producción de químicos potentes y exóticos, hace que varios miembros de esta familia se encuenten bajo investigación farmacológica.

    Several members of the family Apocynaceae have had economic uses in the past. Several are sources of important natural products—pharmacologic tool compounds and drug research candidates, and in some cases actual prescription drugs.[citation needed] Cardiac glycosides, which affect heart function, are a ready example.[citation needed] Members studied and known to have such glycosides include the Acokanthera, Apocynum, Cerbera, Nerium, Thevetia and Strophanthus.[citation needed] Rauvolfia serpentina (Indian snakeroot) synthesizes the alkaloids reserpine and rescinnamine, which are of interest in studies of the treatment of high blood pressure,[citation needed] as well as some forms of psychosis.[citation needed] Catharanthus roseus yields alkaloids studied with regard to the treatment of cancer.[citation needed] Certain species of the genus Tabernanthe, most notably Tabernanthe Iboga contain tryptamine alkaloids such as ibogaine in the roots.[citation needed]
    Extracción artesanal de los alcaloides anticancerígenos...

    https://www.youtube.com/watch?v=GK8ro3UozIo


    Nota: Eso se puede hacer en Venezuela, u otros estados criminales y fallidos, donde no hay medicinas y si no hay de otra... hay que recordar que son venenos muy potentes. Inyectarselos SIEMPRE implicará un riesgo de muerte. Si uno puede comprarlos en la farmacia, es lo mejor.


    ----------------------------
    Como recordar los nombres de las drogas de Quimioterapia:

    https://www.youtube.com/watch?v=fIXBa2rExQI
    (Edición de firma).

  26. #56

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    Materia: Tec. Biol. Mol.
    Tema: Observación de organelos aislados.

    El fraccionamiento celular y la observación o manipulación de organelos aislados de una muestra de tejido es una técnica básica, pero que debe ser dominada por su utilidad.

    https://www.youtube.com/watch?v=mUsN6KyUtRs




    https://www.youtube.com/watch?v=P_rfpS6zYsg



    https://www.youtube.com/watch?v=0_YdxuOdGhU

    (Edición de firma).

  27. #57

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    Ya solo falta ver la preparación de buffers / soluciones de lisis, para ADN y sobre todo, para Proteinas.

    https://www.youtube.com/watch?v=S6bgIeM5wSQ


    Acción de una solución de lisis al microscopio...
    https://www.youtube.com/watch?v=DL1ZlcKo0Ow


    Básicamente hay tres opciones:

    - NP40.
    - RIPA.
    - SDS.

    https://en.wikipedia.org/wiki/Lysis_buffer
    (Edición de firma).

  28. #58

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    Materia: Tec Bol Mol.
    Tema: Ensayo Cometa.
    (Utilidad: Determinación de apoptosis).

    Principio biológico: Detectar si hay ADN frangmentado dentro de una célula.
    Principio físico: Electroforesis de la célula.

    https://www.youtube.com/watch?v=_dJWMD_bCdc


    https://www.youtube.com/watch?v=jFKNGZPRnSg


    Como el último video muestra, no es cuestión solo de tener una herramienta objetiva de medición. Una vez vez que se tiene, se pueden diseñar experimentos de muchos tipos, pero para eso se necesita imaginación.

    Unos videos Noruegos, cortos, sobre el Ensayo Cometa...
    https://www.youtube.com/watch?v=EWrk...D1VivC_diJtsym

    (Edición de firma).

  29. #59

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    Curso Teorico del MIT de Biología Molecular, desde un punto de vista original y técnico.

    Lista de Reproducción, 39 videos.
    https://www.youtube.com/watch?v=TnpC...3B8D8C87426E44



    (Muy buen candidato ser conservado).
    (Edición de firma).

  30. #60

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    Supongamos....

    Supongamos que, además de lo que estamos haciendo - poner orden en unos viejos papeles - REALMENTE me quiero seguir metiendo en este tema del cáncer y de los medicamentos o métodos para tratarlo... Y no solo me conformo con hacer una búsqueda documental en Internet o algunos libros... sino que realmente, quiero hacer algo...

    Células cancerosas... se pueden conseguir sin demasiado problema. Se les puede pedir de cáncer del colon (lo que más me interesa)… o de pulmón... o de algunas otras cosas... y del sabor que se desee (e.g. mutadas de p53, etc.), o sea "de frambuesa".

    xD.

    El caso, es que no se te mueran....

    =(.

    No es lo mismo que tener cultivos de microorganismos... que de todas maneras, ya con algunos de ellos es difícil. Cultivos celulares de animales, mantenidos vivos, relativamente no estresados, y no contaminados durante un tiempo razonable... es por supuesto, bastante difícil.

    Pero tal vez... con un poco de cuidado...

    https://www.youtube.com/watch?v=WGKoJRNKADY



    Lista de Reproducción:
    https://www.youtube.com/watch?v=o35Z...FOZvbY_AI2mO0f

    https://www.youtube.com/watch?v=o35ZQq0Uvzs



    https://www.youtube.com/watch?v=P4dTbKVDIZ4

    (Edición de firma).

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