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Thread: Las Mitocondrias, el Acido Cítrico y el Cancer...

  1. #26

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    Mapa Metabólico Interactivo de MERK

    https://www.sigmaaldrich.com/technic...hways-map.html

    Debe ejecutarse en Chrome, y aún así se ve medio pinche.

    Si se le hace clic a un elemento, despliega información relevante, y también las enzimas que transforman un compuesto en otro, vienen especificadas con su número EC.

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  2. #27

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    La forma del metabolismo, como un grafo enorme con nodos, es muy ameno a ser guardado en una "base de datos" basada en la IA clásica.

    Aunque seguramente, a alguien ya se le ocurrió la idea.

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  3. #28

  4. #29

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    La investigación de punta sobre el Cáncer, no tiene el punto de vista que se relaciona con esto del Acido Cítrico, que es un enfoque metabólico.

    Actualmente sabemos mucho, sobre el ciclo celular, como se controla, como se repara el DNA, sobre oncogenes, mecanismos de control, y formas como todo este sistema puede fallar, en las millones y millones de divisiones celulares que ocurren todos los días en el cuerpo humano, que pueden dar lugar a lo que llamamos cáncer.

    Y sin embargo, las quimioterápias actuales, y desde hace décadas, son precisamente lo contrario... enfoques metabólicos que atacan a células en etapas de división. Son venenos que atacan a células con ciertas características metabólicas... "matar al cáncer sin que mate al sujeto".

    https://es.wikipedia.org/wiki/Quimioterapia

    Pensamos que en algún momento, se inventarán, o se podrá aplicar médicamente, enfoques en el que se pueda convencer a una célula cancerosa, o a morir (como sería su deber ante el daño que ha sufrido), o bien, ayudarla a reparar sus genes dañados. Pero evidentemente todavía no llegamos a ese punto.

    Aunque con seguridad, se llegará en algún momento.

    https://es.wikipedia.org/wiki/Terapia_g%C3%A9nica

    Otro enfoque avanzado, es la inmunoterapia. Mediante el fortalecimiento o manipulación del sistema inmunológico de un paciente, o bien con anticuerpos monoclonales producidos por algún mamífero, atacar específicamente a las células cancerosas. Eventualmente, puede tener un éxito total,... aunque en cuanto en conocimiento total del problema, o bien por costes económicos, todavía no se aplica en forma generalizada... aunque avanza muy rápidamente.

    https://es.wikipedia.org/wiki/Inmuno...el_c%C3%A1ncer

    En realidad, se está avanzando siempre, en diversos frentes:

    https://es.wikipedia.org/wiki/Tratam...el_c%C3%A1ncer

    -------------------------------------------------------

    Sigo ordenando mis notas de la licenciatura en estos temas... y yo también estoy avanzando mucho más rápido de lo que había creído al principio.

    Sin embargo, la información biológica que se ha obtenido con respecto a la fisiología celular, la biología molecular y la genómica y la proteómica es tan grande, que no puede ser manejada fácilmente por los humanos.

    Mi enfoque personal, sería el utilizar la computadora para modelar procesos... aunque la última edición del Alberts, advierte que todavía no se ha tenido mucho éxito al respecto, por la complejidad y las lagunas de conocimiento que actualmente se tienen. Pero ese sería mi enfoque... al menos tentativo, cara en que estos problemas se resuelvan,... algún día.

    Sigo en este tema.

    Al final, creo que sí podré decir algo sobre "El Acido Cítrico y el Cáncer".

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  5. #30

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    Oh! Por poco escapa de mi vista!!! … ya estaba cerrando el browser, y lo vi de un chispazo, ahí listado...

    Sobre este tratamiento con Acido Cítrico, del Dr. Halabe… existe un tratamiento que pretende seguir los mismos principios, pero con un químico que potencia todavía más el efecto que se ve con el Ácido Citrico… el Dicloracetato.

    Según Wikipedia:

    Dicloroacetato[editar]
    Se ha descubierto que el dicloroacetato reduce los tumores in vivo en ratas y tiene un mecanismo científico plausible: el DCA parece reactivar las mitocondrias suprimidas en algunos tipos de células tumorales carentes de oxígeno y, por lo tanto, promueve la apoptosis.4​ Debido a que se probó para otras patologías, se sabe que el DCA es relativamente seguro, está disponible y es económico, y se puede tomar por vía oral como una píldora, lo cual es muy conveniente. Cinco pacientes con cáncer cerebral fueron tratados con DCA en un ensayo clínico, y los autores dicen que el tratamiento logró "probablemente" aumentar la vida de cuatro. Sin embargo, sin una gran prueba controlada, es imposible decir si la droga es realmente efectiva contra el cáncer.5​6​
    https://es.wikipedia.org/wiki/Tratam...Dicloroacetato

    Una de las fuentes no hablan bien de él, previniendo a pacientes que no sean optimistas, pero al parecer... aunque está desaparecida.

    La otra está aquí: https://scienceblog.cancerresearchuk...-early-trials/

    Y la llama "droga controversial".

    … en fin... con el tiempo, sabremos la verdad.

    Debo seguir estudiando.

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  6. #31

  7. #32

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    Cómo vamos:

    - Ya casi estoy repuesto de la lesión que sufrí y que me ha tenido la mayor parte del tiempo en la cama durante varias semanas. Estoy dispuesto a cuidar mejor de mi salud, para no volver a pasar por un episodio así, a ser posible, por un largo rato.

    - Ordenando mis apuntes escolares... ya avancé mucho la parte "Higiénica" del asunto. Poner las cosas en el orden correcto, referenciarlas con sitios externos, ir juntando los programas informáticos a usar... aunque todavía queda bastante por hacer en ese aspecto.

    … después de eso, vendrá el auténtico trabajo de investigación documental... y hacer experimentos.

    - Siempre sí decidí montar algo modesto para hacer algunas cosas básicas de biología... e ir a contactar algunas personas del instituto que tengo cerca.

    Por el momento, así vamos.

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  8. #33

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    Le hice ajustes a mi microscopio... unos ajustes hechizos. Sin embargo ahora puedo ver con relativa facilidad núcleos celulares e ingluso ver algunos detalles, cuando las combinación de luz y enfoque es perfecta.... estoy logrando más de 2500 aumentos.

    Me falta cristalería... y mucho del equipo básico...

    Voy poco a poco.

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  9. #34

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    Bueno... había dicho más arriba que un enfoque de inteligencia artificial para crear y procesar los datos de bases de datos biológicas, podia ser una posibilidad... pero jamás me imaginé que ya existieran proyectos tan enormes en ese aspecto.

    https://es.wikipedia.org/wiki/Cyc

    https://en.wikipedia.org/wiki/BioCyc...ase_collection

    https://www.youtube.com/watch?v=AMvuhfOMkJQ



    ¿Y como di con él?

    https://en.m.wikipedia.org/wiki/Biochemical_cascade

    Como se vé, en realidad, en los últmos años ha estallado el número de bases de datos qeu ofrecen información biológica.

    Hay que ponernos al día.

    Seguimos estudiando.

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  10. #35

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    Para nada... pero para nada he terminado de poner en orden mis notas.

    Y todavía falta un periodo largo, en las que voy a actualizarlas.

    Pero tengo paciencia...

    No voy rápido ni lento.

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  11. #36

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    Mis "brillantes nociones" ya tienen bastantes años de haber sido implementadas...

    https://es.wikipedia.org/wiki/Modela...tab%C3%B3licas

    … pues ¡Que bien!.

    Seguiremos estudiando.

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  12. #37

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    De momento estoy haciendo una labor relativamente "aburrida"... sin embargo, lo estoy haciendo para posteriormente, poder encontrar por todo el internet la información que necesito.

    El internet está lleno de información, y solo hay que saber como buscarla, como encontrarla... como manejarla.

    Con poderosos nuevos enfoques que estoy intentando implementar.

    Cuando realmente arranque mi estudio... necesitaré uno o varios discos externos para guardar toda la información. A un solo toque... se me despliegan toneladas de información sobre un concepto.

    --------------------------------------------
    Es motivante detenerse un momento, y ver que puedo encontrar, por ejemplo, buenos videos como estos, sobre el plegamiento de las proteínas con asistencia y control de chaperonas, como la calnexina…

    https://www.youtube.com/watch?v=nEHe3Aie9Ek


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  13. #38

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    Ayer... no pude evitar sentirme un poco triste de ver que algunas ideas que yo consideraba originales y únicas (i.e. aplicación de la IA y la modelación matemática al metabolismo), ya tienen años o hasta lustros de implementación.

    Sin embargo, soy yo el que, por ejemplo estos temas de biología, los abandono durante años y hasta lustros... y el progreso, por supuesto, no se detiene.

    Vivimos en un mundo inestable... mi ánimo, mi salud mental y física... son inestables... y por supuesto, tienen fecha de caducidad, incluso. El ambiente donde me muevo es inestable en sí... y sin embargo, no vivo en un lugar donde tema que en la mañana salga a hacer cosas y me encuentre con una balacera (como algunos foristas de este foro)… pero por supuesto, TAMBIEN este ambiente, y estos tiempos, son inestables... y esto también tiene su inestabilidad... pero sobre todo, fecha de caducidad... como este país.

    Todo en nuestra vida es aleatorio... y los momentos tristes y alegres, también.

    Ya no me siento triste.

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  14. #39

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    Un buen libro, tengo que conseguirlo.

    https://kissly.net/book/A9E5A8214F77...fnom&x=3286934

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  15. #40

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    Pero, de todas maneras, seguiré en esa linea...

    Repasos: Cursos de Prolog y Programación Lógica:

    Curso de Prolog por un Hindú, cuyo inglés no es tan incomprensible... es muy incómodo, que el curso consta de 78 videos, la mayoría muy corto (promedio: 5 min.)

    https://www.youtube.com/watch?v=rSZS...oqplBhJF91Mwkp

    Curso de un Angloparlante, 1 solo video de una hora.

    https://www.youtube.com/watch?v=SykxWpFwMGs

    Curso de 27 videos, de un tipo con cara de Pakistaí, con no tan mal inglés.

    https://www.youtube.com/watch?v=4vv3...OO8ch_Di7T8_9E

    ------------------------

    Nota:

    Una cosa es aprender este lenguaje, y otro es aprender a utilizarlo en forma "util", y por ahí debe haber - aunque no se donde - donde se enseñe eso.

    La filosofía Mecatrónica, ofrece un punto de vista muy, pero muy interesante, de como utilizar la Programación Lógica. Sería cuestión de buscar más.

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  16. #41

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    José Antonio le preguntó al Dr. Halabe Bucay sobre publicaciones serias sobre el ácido cítrico como tratamiento de cáncer... parece que no quedó muy satisfecho con su respuesta.

    Pasando ahora a una sustancia que va en ese sentido, con el mismo mecanismo, pero con efectos potenciados - el dicloracetato - tenemos miles de entradas en la base de datos del NCBI.

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/search/...ichloroacetate

    Ciertamente, he tomado algunos cursos de Biología Molecular, y al leer un artículo científico, entiendo casi todo... pero me doy cuenta que cosas tan básicas como dominar las bases de datos, el software, y todo lo que ofrecen las grandes bases de datos públicas biológicas... ES ALGO QUE NO HE EXPLOTADO.

    También, tengo una tendencia a querer construir mi propio conocimiento desde cero... mis propios métodos desde cero... pero eso, en mi limitado tiempo, no me va a llevar muy lejos.

    Después de terminar el trabajo de repaso de estos cursos,... todavía deberemos hacer un esfuerzo por dominar esa información. Lo cual, tampoco está peleado, con hacerlo a mi manera.

    Original y poderosa.

    ;).

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  17. #42

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    Intento de enciclopedia informatica del "Instituto Quimico Biológico". (España)

    Llegué aquí porque tenían información interesante sobre el cromosoma 6. (https://www.iqb.es/cromosomas/cromosoma06.htm)

    Me parece que es un punto de vista interesante... pero requería una cantidad de trabajo, y no lo avanzaron mucho.

    https://www.iqb.es/mapa.htm

    -------------------------------
    ¿Que veo en Wikipedia?

    Al menos para el Cromosoma 1:

    Para cada entrada de un cromosoma en la Wikipedia en inglés, se tiene el gene o la familia de genes, y se da el locus aproximado. Esto luego puede buscarse en NCBI, donde tienen mapas detallados que pueden aumentarse por órdenes de magnitud… (no se si hasta nucleótidos invidivuales). Aunque también se puede buscar a un gene por su nombre.

    Hasta abajo, se tienen las enfermedades genéticas identificadas con ese cromosoma... aunque aquí no se detallan los loci... pueden quizá cruzarse a mano con la información de arriba.

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  18. #43

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    https://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_1

    Mmmm…. pero según recuerdo, cada entrada de gene en Wikipedia en inglés, tiene el locus exacto... e incluso, desde ahí mismo se dan link para accesar a bases de datos públicas.... que se van llamando una a la otra (e.g. artículos científicos y médicos sobre ese gen)… por lo que se cierra el círculo.
    Last edited by Sirius2b; 14-11-19 at 04:23 PM.

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  19. #44

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    Mmm… en mis viejas notas encontré que los perros tienen un cáncer venéreo transmisible, similar al cáncer facial de los Demonios de Tasmania.

    Ya hablando sobre cosas que realmente funcionan contra el cáncer, y no solo especulaciones, tenemos por ejemplo a la planta anti-cáncer Catharanthus roseus… productoras del alcaloide "Vincristine". Muy utilizado para combatir tumores, no solo de humanos... también en perros y otros mamíferos.

    https://en.wikipedia.org/wiki/Catharanthus_roseus

    El Vincristine, no parece ser muy caro - salvo si uno vive en Venezuela... o en el futuro de algunos años, en México - Debe ser administrado con cuidado, porque una inyección mal colocada, puede ser LETAL.

    Canharanthus pertenece a Eudicots --> Asteridas --> Gentinales…. un orden algo exótico, al menos no se ve en un curso introductorio de botánica.

    Interesante.

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  20. #45

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    Ejemplo de un Visualizador Genómico, este desarrollado por la UCSC (University of California, Santa Cruz). El link de abajo muestra el Cromosoma 1.

    El visualizador puede aumentarse muchos órdenes de magnitud (casi, creo, hasta pares de bases), o como se vé, mostrar todo el cromosoma. Puede darse clic directamente en el ideograma del cromosoma, si uno puede guiarse en lo que busca, por el bandeo.

    Nótese las numerosísimas opciones (docenas) para centrar la búsqueda.

    http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTra...tbU3DZeinaYlPG

    El sitio tiene los genomas de los organismos modelo más comunes (Aradobiopsis taliana, Mus musculus, etc.), y aspira a expanderse.

    Este visualizador, creo que está empotrado en algunas páginas del NCBI.

    Sitio: http://genome.ucsc.edu/index.html

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  21. #46

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    Mi filosofía...

    Un genetista (o un médico, o un biólogo) debe conocer a los cromosomas humanos íntimamente, como sus "amigos"... quizá nunca logre entenderlos por completo... pero si lo suficiente para tratar con ellos, saber cuando están en una situación anormal, y que consecuencias trae eso.

    Algo que vale la pena estudiar... algo fijo, que durará... y si no dura... jo, jo…

    Todavía mejor.

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  22. #47

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    Este tema... ¿Lo estamos viendo en orden o en desorden? Digamos que lo estamos viendo en desorden... pero no es tan grave.

    Siempre y cuando quede claro a que materia y tema pertenece cada cosa que pongamos acá, o implícitamente quede suficientemente claro, creo que no hay problema.

    Creo que ya llegó el momento, de ir poniendo algunos videos interesantes.

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  23. #48

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    Materia: Tec. Biología Molecular.
    Tema: Inmunología (CMH, HLA, Cromosoma 6, Anticuerpos, etc.)

    Nótese que este curso nos hace avanzar mucho en distintos temas que se necesitan ver en Biología Molecular.

    Este curso sí hay que bajarlo.

    Curso completo de la Universidad de Valladolid (España).

    Lista de Reproducción: https://www.youtube.com/watch?v=IdM7...afihsdvEmW2dng

    Video inicial:


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  24. #49

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    Muy buenos videos.... divertidos e ingeniosos...


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  25. #50

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